怀德学院教学管理工作是在院长领导下建立的怀德学院院、系两级管理体系。该体系由分管教学的副院长、各系系主任、教务办公室和各系教学秘书组成,对教学管理的整体工作进行研究、部署、协调和落实。在怀德学院统一部署下,各系教学管理工作由系主任负责运行;各系教学秘书协助系主任进行系教学管理的日常工作。院教务办公室在分管教学领导的部署下,负责怀德学院教学管理各项工作的协调、督促和落实,并协助分管教学院长做好日常工作。